普陀区共调查记录到鸟类254种，隶属于18目55科145属。

有国家一级重点保护鸟类3种：黄嘴白鹭、黑脸琵鹭、秃鹫，国家二级重点保护鸟类39种：鸳鸯、小鸦鹃、白腰杓鹬、翻石鹬、大凤头燕鸥、白琵鹭、栗头鳽、岩鹭等。

列入《中国生物多样性红色名录 脊椎动物卷》中濒危（EN）等级的鸟类有1种：黑脸琵鹭；易危（VU）的鸟类有7种：黄嘴白鹭、林雕、仙八色鸫等。

被列入浙江省重点保护野生动物名录的有36种，包括豆雁、鸳鸯、罗纹鸭、褐翅燕鸥等。